在很多情況下，板式換熱器易結垢，會嚴重影響到板式換熱器的換熱效率，是因為板式換熱器大多是以水為載熱體的換熱系統，由于某些鹽類在溫度升高時從水中結晶析出，附著于換熱管表面，形成水垢。
在冷卻水中加入聚磷酸鹽類緩沖劑，當水的PH值較高時，也可導致水垢析出。初期形成的水垢比較松軟，但隨著垢層的生成，傳熱條件惡化，水垢中的結晶水逐漸失去，垢層即變硬，并牢固地附著于換熱管表面上。
此外，如同水垢一樣，當換熱器的工作條件適合溶液析出晶體時，換熱管表面上即可積附由物料結晶形成的垢層；當流體所含的機械雜質有機物較多、而流體的流速又較小時，部分機械雜質或有機物也會在換熱器內沉積，形成疏松、多孔或膠狀污垢。
